А.С. Деникин окончил Чувашский государственный университет имени И. Н. Ульянова, в 1999 году — аспирантуру этого вуза, имеет ученую степень кандидата физико-математических наук и ученое звание доцента.

Его трудовая деятельность началась в Чувашском госуниверситете, затем была работа в Объединенном институте ядерных исследований в Дубне и дубнинском университете, где до назначения он занимал должность проректора по учебно-методической работе.